Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
UBXN4Q92575 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms