Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATG4AQ8WYN0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms