Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAAF4Q8WXU2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF4Q8WXU2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms