Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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ZNF398Q8TD17 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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ZNF398Q8TD17 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF398Q8TD17 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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ZNF398Q8TD17 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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ZNF398Q8TD17 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ZNF398Q8TD17 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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ZNF398Q8TD17 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF398Q8TD17 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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