Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATL2Q8NHH9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms