Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A9Q8IVB4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A9Q8IVB4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms