Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNL1Q8IU54 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNL1Q8IU54 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms