Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APTXQ7Z2E3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms