Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHA9Q7RTU4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms