Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLC29A4Q7RTT9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC29A4Q7RTT9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms