Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM43Q6ZSC3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM43Q6ZSC3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms