Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A47Q6Q0C1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SLC25A47Q6Q0C1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms