Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOBEC3HQ6NTF7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APOBEC3HQ6NTF7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms