Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms