Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms