Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHX8Q68G74 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHX8Q68G74 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms