Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARMC3Q5W041 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ARMC3Q5W041 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms