Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ATRNL1Q5VV63 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms