Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRPF38BQ5VTL8 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms