Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FFAR4Q5NUL3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
FFAR4Q5NUL3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms