Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FGD3Q5JSP0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FGD3Q5JSP0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms