Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CT47A1Q5JQC4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CT47A1Q5JQC4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms