Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HERC4Q5GLZ8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HERC4Q5GLZ8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms