Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC178Q5BJE1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC178Q5BJE1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms