Protein–RNA interactions for Protein: Q53S33

BOLA3, BolA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA3Q53S33 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BOLA3Q53S33 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BOLA3Q53S33 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BOLA3Q53S33 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BOLA3Q53S33 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms