Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA8Q53HL2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA8Q53HL2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms