Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TWISTNBQ3B726 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TWISTNBQ3B726 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms