Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODF4Q2M2E3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms