Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC27Q2M243 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC27Q2M243 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms