Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC142Q17RM4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC142Q17RM4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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