Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP7Q16576 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms