Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALX1Q15699 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALX1Q15699 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
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