Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TWIST1Q15672 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TWIST1Q15672 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms