Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SS18Q15532 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SS18Q15532 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18Q15532 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SS18Q15532 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18Q15532 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18Q15532 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18Q15532 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18Q15532 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18Q15532 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SS18Q15532 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SS18Q15532 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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