Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PEX19-208ENST00000532508 1237 ntTSL 512.8□□□□□ -0.367e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-206ENST00000395499 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SMARCA4-217ENST00000591595 3377 ntTSL 212.7□□□□□ -0.387e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.397e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-203ENST00000403222 3728 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.47e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 FKBP8-210ENST00000599540 1140 ntTSL 212.45□□□□□ -0.427e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 INTS6L-206ENST00000639893 3904 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DHX38-203ENST00000563650 1123 ntTSL 312.1□□□□□ -0.477e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.497e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-204ENST00000407373 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 C9orf78-202ENST00000461349 783 ntTSL 311.65□□□□□ -0.547e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MRPS24-205ENST00000483330 392 ntTSL 211.55□□□□□ -0.567e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-203ENST00000477813 1945 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SLC9A8-202ENST00000417961 6309 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 YARS-208ENST00000487404 2197 ntTSL 211.34□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 YARS-203ENST00000469100 2247 ntTSL 211.13□□□□□ -0.637e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-215ENST00000575677 570 ntTSL 311.12□□□□□ -0.635e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-216ENST00000576994 571 ntTSL 411.02□□□□□ -0.655e-9■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 FAM129A-204ENST00000487074 3118 ntTSL 510.85□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-214ENST00000454145 589 ntTSL 410.85□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 CAPN1-204ENST00000526468 690 ntTSL 310.84□□□□□ -0.677e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PEX19-210ENST00000532643 894 ntTSL 210.77□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PEX19-202ENST00000392220 796 ntTSL 510.77□□□□□ -0.697e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NAA50-210ENST00000616174 3257 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.692e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AL136115.2-201ENST00000602889 587 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.77e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 BNIP3L-203ENST00000520077 922 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.723e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-205ENST00000564781 540 ntTSL 510.54□□□□□ -0.725e-9■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 YARS-206ENST00000478828 1044 ntTSL 210.4□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PEX19-206ENST00000495624 734 ntTSL 310.36□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 APBB3-209ENST00000504872 538 ntTSL 410.35□□□□□ -0.757e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 OSBP2-205ENST00000424224 861 ntTSL 310.27□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AGPAT1-208ENST00000490711 2448 ntTSL 210.26□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.797e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-211ENST00000568099 540 ntTSL 510.07□□□□□ -0.85e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATG7-223ENST00000478638 520 ntTSL 59.81□□□□□ -0.847e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATG7-218ENST00000461278 545 ntTSL 49.47□□□□□ -0.897e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PEX19-205ENST00000472750 3504 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.97e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATG7-209ENST00000434066 553 ntTSL 59.31□□□□□ -0.927e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATG7-207ENST00000424071 758 ntTSL 39.09□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 AL139011.2-202ENST00000485079 914 ntTSL 38.9□□□□□ -0.987e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 NSUN2-204ENST00000505264 472 ntTSL 48.85□□□□□ -0.997e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -17e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 BNIP3L-207ENST00000523949 875 ntTSL 38.56□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PTP4A2-213ENST00000532001 911 ntTSL 58.32□□□□□ -1.087e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-209ENST00000566306 544 ntTSL 48.13□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-210ENST00000567100 567 ntTSL 48.13□□□□□ -1.115e-9■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-213ENST00000570709 569 ntTSL 48.03□□□□□ -1.125e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.147e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PEX19-204ENST00000467711 205 ntTSL 37.86□□□□□ -1.157e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.167e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MFN2-205ENST00000490079 445 ntTSL 27.09□□□□□ -1.277e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 USP36-204ENST00000586066 960 ntTSL 56.98□□□□□ -1.297e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-212ENST00000569289 373 ntTSL 56.96□□□□□ -1.35e-9■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PTP4A2-210ENST00000528253 806 ntTSL 56.81□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DUS2-214ENST00000571081 570 ntTSL 45.76□□□□□ -1.495e-9■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PEX19-203ENST00000462644 904 ntTSL 35.5□□□□□ -1.537e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PTP4A2-205ENST00000484483 651 ntTSL 25.4□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 38.1
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EFTUD2Q15029 SF3A3-207ENST00000488934 273 ntTSL 54.82□□□□□ -1.647e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.757e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 INTS6L-204ENST00000493637 6710 ntTSL 1 (best)4.06□□□□□ -1.767e-7■■■■■ 38.1
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EFTUD2Q15029 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -27e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HMGN2-204ENST00000464888 565 ntTSL 210.03□□□□□ -0.87e-12■■■■■ 38.1
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EFTUD2Q15029 HMGN2-208ENST00000479815 1030 ntTSL 58.67□□□□□ -1.027e-12■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HMGN2-206ENST00000467700 932 ntTSL 27.11□□□□□ -1.277e-12■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HMGN2-207ENST00000468388 320 ntTSL 36.63□□□□□ -1.357e-12■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.357e-12■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.67e-12■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 YTHDF3-211ENST00000619337 545 ntTSL 422.3■■□□□ 1.163e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.983e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.93e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 YTHDF3-207ENST00000613853 563 ntTSL 418.29■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HLA-C-208ENST00000487245 1880 nt27.19■■□□□ 1.943e-6■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HLA-C-202ENST00000376237 1538 nt22.77■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.033e-6■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.023e-6■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC13.06□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 HLA-B-258ENST00000640615 240 ntBASIC8.76□□□□□ -1.013e-6■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 MSRB1-204ENST00000489198 709 ntTSL 311.43□□□□□ -0.586e-11■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATP5B-205ENST00000548647 682 ntTSL 515.09■□□□□ 0.019e-22■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-205ENST00000587097 1341 ntTSL 528.35■■■□□ 2.137e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SRRM2-226ENST00000576415 461 ntTSL 224.42■■□□□ 1.51e-39■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SRRM2-223ENST00000575701 860 ntTSL 324.17■■□□□ 1.461e-39■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 SRRM2-219ENST00000574340 579 ntTSL 318.45■□□□□ 0.541e-13■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-202ENST00000454077 3523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-201ENST00000389384 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.637e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ANXA2-223ENST00000559647 484 ntTSL 28.62□□□□□ -1.033e-10■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 ATXN7L3-212ENST00000593073 527 ntTSL 47.98□□□□□ -1.137e-8■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RPL36A-207ENST00000489407 373 ntTSL 23.32□□□□□ -1.882e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DCXR-221ENST00000585164 475 ntTSL 521.21■□□□□ 0.996e-9■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 ACAD9-206ENST00000511227 2431 ntTSL 217.23■□□□□ 0.353e-6■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 38
EFTUD2Q15029 ACAD9-208ENST00000511526 1896 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 38
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