Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
ODF1Q14990 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
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ODF1Q14990 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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ODF1Q14990 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ODF1Q14990 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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