Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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COL4A6Q14031 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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COL4A6Q14031 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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COL4A6Q14031 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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COL4A6Q14031 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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COL4A6Q14031 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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COL4A6Q14031 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COL4A6Q14031 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
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