Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF2H3Q13889 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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