Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EXOSC2Q13868 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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