Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP1A4Q13733 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
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