Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA7Q13683 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA7Q13683 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms