Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CUL4BQ13620 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
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