Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC1Q13547 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC1Q13547 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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