Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TOP3AQ13472 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TOP3AQ13472 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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