Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
FOXE3Q13461 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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FOXE3Q13461 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FOXE3Q13461 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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