Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNTA1Q13424 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNTA1Q13424 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
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