Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB3BPQ13352 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGB3BPQ13352 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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