Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2BQ13224 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
GRIN2BQ13224 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GRIN2BQ13224 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms