Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF3Q13114 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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TRAF3Q13114 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
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