Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CDC16Q13042 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CDC16Q13042 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms